Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. HOOPS unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von HOOPS unterstützten Basisdateien sind .HSF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in HOOPS zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von HOOPS verwendet werden.
Mit HOOPS können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über HOOPS öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von HOOPS unterstützten Dateiformat zu speichern.