Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. HippoDraw unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von HippoDraw unterstützten Basisdateien sind .HPO. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in HippoDraw zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von HippoDraw verwendet werden.
Mit HippoDraw können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über HippoDraw öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von HippoDraw unterstützten Dateiformat zu speichern.