Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Hedgewars unterstützt mindestens 3 verschiedene Dateiendungen. Die von Hedgewars unterstützten Basisdateien sind .HWS. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Hedgewars zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Hedgewars verwendet werden.
Mit Hedgewars können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Hedgewars öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Hedgewars unterstützten Dateiformat zu speichern.