Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. GPSMapEdit unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von GPSMapEdit unterstützten Basisdateien sind .NM2. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in GPSMapEdit zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von GPSMapEdit verwendet werden.
Mit GPSMapEdit können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über GPSMapEdit öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von GPSMapEdit unterstützten Dateiformat zu speichern.