Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. GPS Pathfinder Office unterstützt mindestens 5 verschiedene Dateiendungen. Die von GPS Pathfinder Office unterstützten Basisdateien sind .SSF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in GPS Pathfinder Office zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von GPS Pathfinder Office verwendet werden.
Mit GPS Pathfinder Office können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über GPS Pathfinder Office öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von GPS Pathfinder Office unterstützten Dateiformat zu speichern.