Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. GNU project C unterstützt mindestens 5 verschiedene Dateiendungen. Die von GNU project C unterstützten Basisdateien sind .LUA. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in GNU project C zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von GNU project C verwendet werden.
Mit GNU project C können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über GNU project C öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von GNU project C unterstützten Dateiformat zu speichern.