Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. GLPK unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von GLPK unterstützten Basisdateien sind .DAT. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in GLPK zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von GLPK verwendet werden.
Mit GLPK können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über GLPK öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von GLPK unterstützten Dateiformat zu speichern.