Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Girder unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Girder unterstützten Basisdateien sind .BGR. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Girder zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Girder verwendet werden.
Mit Girder können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Girder öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Girder unterstützten Dateiformat zu speichern.