Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Geospiza FinchTV unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Geospiza FinchTV unterstützten Basisdateien sind .FASTA. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Geospiza FinchTV zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Geospiza FinchTV verwendet werden.
Mit Geospiza FinchTV können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Geospiza FinchTV öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Geospiza FinchTV unterstützten Dateiformat zu speichern.