Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. GeoGebra unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von GeoGebra unterstützten Basisdateien sind .GGB. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in GeoGebra zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von GeoGebra verwendet werden.
Mit GeoGebra können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über GeoGebra öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von GeoGebra unterstützten Dateiformat zu speichern.