Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Gemcom GEMS unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Gemcom GEMS unterstützten Basisdateien sind .GGP. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Gemcom GEMS zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Gemcom GEMS verwendet werden.
Mit Gemcom GEMS können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Gemcom GEMS öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Gemcom GEMS unterstützten Dateiformat zu speichern.