Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. GConf unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von GConf unterstützten Basisdateien sind .SCHEMAS. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in GConf zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von GConf verwendet werden.
Mit GConf können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über GConf öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von GConf unterstützten Dateiformat zu speichern.