Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FX Graph unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von FX Graph unterstützten Basisdateien sind .FG3. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FX Graph zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FX Graph verwendet werden.
Mit FX Graph können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FX Graph öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FX Graph unterstützten Dateiformat zu speichern.