Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. funzip unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von funzip unterstützten Basisdateien sind .ZIP. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in funzip zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von funzip verwendet werden.
Mit funzip können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über funzip öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von funzip unterstützten Dateiformat zu speichern.