Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FreeWRL unterstützt mindestens 4 verschiedene Dateiendungen. Die von FreeWRL unterstützten Basisdateien sind .WRL. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FreeWRL zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FreeWRL verwendet werden.
Mit FreeWRL können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FreeWRL öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FreeWRL unterstützten Dateiformat zu speichern.