Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Free Hide Folder unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Free Hide Folder unterstützten Basisdateien sind .FHF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Free Hide Folder zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Free Hide Folder verwendet werden.
Mit Free Hide Folder können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Free Hide Folder öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Free Hide Folder unterstützten Dateiformat zu speichern.