Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Forensic Toolkit unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von Forensic Toolkit unterstützten Basisdateien sind .AD1. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Forensic Toolkit zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Forensic Toolkit verwendet werden.
Mit Forensic Toolkit können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Forensic Toolkit öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Forensic Toolkit unterstützten Dateiformat zu speichern.