Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Foobar2000 unterstützt mindestens 16 verschiedene Dateiendungen. Die von Foobar2000 unterstützten Basisdateien sind .M3U8. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Foobar2000 zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Foobar2000 verwendet werden.
Mit Foobar2000 können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Foobar2000 öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Foobar2000 unterstützten Dateiformat zu speichern.