Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FontTwister unterstützt mindestens 4 verschiedene Dateiendungen. Die von FontTwister unterstützten Basisdateien sind .SHADOW. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FontTwister zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FontTwister verwendet werden.
Mit FontTwister können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FontTwister öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FontTwister unterstützten Dateiformat zu speichern.