Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FO3 Archive unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von FO3 Archive unterstützten Basisdateien sind .BSA. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FO3 Archive zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FO3 Archive verwendet werden.
Mit FO3 Archive können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FO3 Archive öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FO3 Archive unterstützten Dateiformat zu speichern.