Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FMS32 unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von FMS32 unterstützten Basisdateien sind .TON. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FMS32 zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FMS32 verwendet werden.
Mit FMS32 können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FMS32 öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FMS32 unterstützten Dateiformat zu speichern.