Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FlashWizard PRO unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von FlashWizard PRO unterstützten Basisdateien sind .NFI. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FlashWizard PRO zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FlashWizard PRO verwendet werden.
Mit FlashWizard PRO können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FlashWizard PRO öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FlashWizard PRO unterstützten Dateiformat zu speichern.