Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FlashWizard unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von FlashWizard unterstützten Basisdateien sind .NFI. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FlashWizard zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FlashWizard verwendet werden.
Mit FlashWizard können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FlashWizard öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FlashWizard unterstützten Dateiformat zu speichern.