Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FLAMES unterstützt mindestens 4 verschiedene Dateiendungen. Die von FLAMES unterstützten Basisdateien sind .FPB. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FLAMES zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FLAMES verwendet werden.
Mit FLAMES können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FLAMES öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FLAMES unterstützten Dateiformat zu speichern.