Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FindinSite-MS unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von FindinSite-MS unterstützten Basisdateien sind .HIS. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FindinSite-MS zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FindinSite-MS verwendet werden.
Mit FindinSite-MS können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FindinSite-MS öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FindinSite-MS unterstützten Dateiformat zu speichern.