Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FilePackager unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von FilePackager unterstützten Basisdateien sind .FXC. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FilePackager zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FilePackager verwendet werden.
Mit FilePackager können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FilePackager öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FilePackager unterstützten Dateiformat zu speichern.