Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FileMaker Go unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von FileMaker Go unterstützten Basisdateien sind .FMP12. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FileMaker Go zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FileMaker Go verwendet werden.
Mit FileMaker Go können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FileMaker Go öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FileMaker Go unterstützten Dateiformat zu speichern.