Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. F.E.A.R. 2: Project Origin unterstützt mindestens 4 verschiedene Dateiendungen. Die von F.E.A.R. 2: Project Origin unterstützten Basisdateien sind .MOPP. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in F.E.A.R. 2: Project Origin zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von F.E.A.R. 2: Project Origin verwendet werden.
Mit F.E.A.R. 2: Project Origin können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über F.E.A.R. 2: Project Origin öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von F.E.A.R. 2: Project Origin unterstützten Dateiformat zu speichern.