Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FBackup unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von FBackup unterstützten Basisdateien sind .FKC. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FBackup zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FBackup verwendet werden.
Mit FBackup können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FBackup öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FBackup unterstützten Dateiformat zu speichern.