Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FastCGI unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von FastCGI unterstützten Basisdateien sind .FCGI. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FastCGI zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FastCGI verwendet werden.
Mit FastCGI können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FastCGI öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FastCGI unterstützten Dateiformat zu speichern.