Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Fallout 3 unterstützt mindestens 7 verschiedene Dateiendungen. Die von Fallout 3 unterstützten Basisdateien sind .BSA. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Fallout 3 zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Fallout 3 verwendet werden.
Mit Fallout 3 können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Fallout 3 öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Fallout 3 unterstützten Dateiformat zu speichern.