Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. FairUse Wizard unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von FairUse Wizard unterstützten Basisdateien sind .FUD. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in FairUse Wizard zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von FairUse Wizard verwendet werden.
Mit FairUse Wizard können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über FairUse Wizard öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von FairUse Wizard unterstützten Dateiformat zu speichern.