Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. ePreserver unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von ePreserver unterstützten Basisdateien sind .PFC. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in ePreserver zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von ePreserver verwendet werden.
Mit ePreserver können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über ePreserver öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von ePreserver unterstützten Dateiformat zu speichern.