Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Ensoniq Disk Tools unterstützt mindestens 9 verschiedene Dateiendungen. Die von Ensoniq Disk Tools unterstützten Basisdateien sind .EDS. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Ensoniq Disk Tools zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Ensoniq Disk Tools verwendet werden.
Mit Ensoniq Disk Tools können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Ensoniq Disk Tools öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Ensoniq Disk Tools unterstützten Dateiformat zu speichern.