Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. EncryptOnClick unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von EncryptOnClick unterstützten Basisdateien sind .EOC. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in EncryptOnClick zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von EncryptOnClick verwendet werden.
Mit EncryptOnClick können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über EncryptOnClick öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von EncryptOnClick unterstützten Dateiformat zu speichern.