Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Encrypt4all unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von Encrypt4all unterstützten Basisdateien sind .ETFF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Encrypt4all zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Encrypt4all verwendet werden.
Mit Encrypt4all können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Encrypt4all öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Encrypt4all unterstützten Dateiformat zu speichern.