Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. eManager unterstützt mindestens 5 verschiedene Dateiendungen. Die von eManager unterstützten Basisdateien sind .XES. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in eManager zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von eManager verwendet werden.
Mit eManager können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über eManager öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von eManager unterstützten Dateiformat zu speichern.