Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. ELAN unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von ELAN unterstützten Basisdateien sind .PFSX. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in ELAN zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von ELAN verwendet werden.
Mit ELAN können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über ELAN öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von ELAN unterstützten Dateiformat zu speichern.