Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Ecrypt unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Ecrypt unterstützten Basisdateien sind .ECR. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Ecrypt zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Ecrypt verwendet werden.
Mit Ecrypt können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Ecrypt öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Ecrypt unterstützten Dateiformat zu speichern.