Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. EAGLE Layout Editor unterstützt mindestens 6 verschiedene Dateiendungen. Die von EAGLE Layout Editor unterstützten Basisdateien sind .SCH. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in EAGLE Layout Editor zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von EAGLE Layout Editor verwendet werden.
Mit EAGLE Layout Editor können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über EAGLE Layout Editor öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von EAGLE Layout Editor unterstützten Dateiformat zu speichern.