Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Dundjinni unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von Dundjinni unterstützten Basisdateien sind .DJA. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Dundjinni zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Dundjinni verwendet werden.
Mit Dundjinni können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Dundjinni öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Dundjinni unterstützten Dateiformat zu speichern.