Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Dr.Explain unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Dr.Explain unterstützten Basisdateien sind .GUI. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Dr.Explain zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Dr.Explain verwendet werden.
Mit Dr.Explain können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Dr.Explain öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Dr.Explain unterstützten Dateiformat zu speichern.