Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Dream Aquarium unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von Dream Aquarium unterstützten Basisdateien sind .DAI. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Dream Aquarium zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Dream Aquarium verwendet werden.
Mit Dream Aquarium können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Dream Aquarium öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Dream Aquarium unterstützten Dateiformat zu speichern.