Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. DeepBurner unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von DeepBurner unterstützten Basisdateien sind .DBR. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in DeepBurner zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von DeepBurner verwendet werden.
Mit DeepBurner können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über DeepBurner öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von DeepBurner unterstützten Dateiformat zu speichern.