Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Dataphor unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Dataphor unterstützten Basisdateien sind .D4. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Dataphor zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Dataphor verwendet werden.
Mit Dataphor können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Dataphor öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Dataphor unterstützten Dateiformat zu speichern.