Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Data Acquisition Toolbox unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Data Acquisition Toolbox unterstützten Basisdateien sind .DAQ. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Data Acquisition Toolbox zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Data Acquisition Toolbox verwendet werden.
Mit Data Acquisition Toolbox können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Data Acquisition Toolbox öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Data Acquisition Toolbox unterstützten Dateiformat zu speichern.