Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Commander Keen: Goodbye Galaxy Set unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von Commander Keen: Goodbye Galaxy Set unterstützten Basisdateien sind .CK4. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Commander Keen: Goodbye Galaxy Set zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Commander Keen: Goodbye Galaxy Set verwendet werden.
Mit Commander Keen: Goodbye Galaxy Set können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Commander Keen: Goodbye Galaxy Set öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Commander Keen: Goodbye Galaxy Set unterstützten Dateiformat zu speichern.