Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. CNwin unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von CNwin unterstützten Basisdateien sind .CN. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in CNwin zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von CNwin verwendet werden.
Mit CNwin können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über CNwin öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von CNwin unterstützten Dateiformat zu speichern.