Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. ClipMagic unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von ClipMagic unterstützten Basisdateien sind .CLP. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in ClipMagic zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von ClipMagic verwendet werden.
Mit ClipMagic können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über ClipMagic öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von ClipMagic unterstützten Dateiformat zu speichern.