Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Capture One unterstützt mindestens 5 verschiedene Dateiendungen. Die von Capture One unterstützten Basisdateien sind .IIQ. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Capture One zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Capture One verwendet werden.
Mit Capture One können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Capture One öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Capture One unterstützten Dateiformat zu speichern.